La crisis de la biodiversidad que afecta a la Tierra, conducida por el Cambio Global, requiere respuestas coordinadas a escala planetaria, pero las acciones inmediatas deben ser planificadas y ejecutadas a escala local. La información sobre distribución geográfica de la biodiversidad, procesada mediante las tecnologías de la información, puede mejorar nuestra perspectiva sobre el problema, facilitando el desarrollo de modelos que nos ayuden a entender las relaciones entre los factores implicados y abriendo paso al diseño e implementación de soluciones. En esta Tesis exploro una metodología de análisis y pronóstico, los Modelos de Distribución de Especies (MDE), que son herramientas diseñadas para calcular la distribución geográfica potencial de las especies a partir de registros de presencia y variables ambientales (topografía, clima, usos del suelo, etc.). Los MDE tienen como soporte conceptual las teorías sobre distribución de organismos y como soporte funcional las tecnologías de la información. En el trabajo que presento trato de utilizar y extender las posibilidades de los MDE para ofrecer respuestas a problemas de conservación en la flora de Andalucía.Esta Tesis está dividida en tres Partes: En la Parte I, que puede considerarse la Introducción General, trato de describir la esencia de los MDE. El Capítulo 1 contiene una introducción a las teorías sobre distribución de organismos en las que se apoyan los MDE, descritas desde la perspectiva de la ecología vegetal. El Capítulo 2 trata sobre el marco disciplinar al que pertenecen los MDE (la Ecoinformática), la naturaleza de los modelos, los MDE, el proceso de modelado, las incertidumbres, limitaciones y aplicaciones de la herramienta. La Parte II y la Parte III forman el núcleo práctico, que describe los distintos trabajos de simulación realizados. Estas dos partes siguen un orden cronológico en cuanto al orden de realización de los distintos trabajos. Como consecuencia existe en esta Tesis una línea ascendente en cuanto a complejidad en la aplicación de los MDE, que coincide con una adquisición progresiva de conocimientos sobre el funcionamiento y aplicaciones de la herramienta. En los trabajos de simulación descritos en esta partes trato de profundizar en dos problemas que ponen en riesgo la diversidad vegetal del sur de la península Ibérica: el Cambio de Uso del Suelo, y el Cambio del Clima. En la Parte II, uso los invernaderos en el sureste árido ibérico como ejemplo paradigmático del conflicto entre la conservación de la diversidad biológica y el desarrollo económico, para: a) desarrollar un método para localizar potenciales conflictos espaciales entre la construcción de nuevos invernaderos y especies vegetales amenazadas; b) utilizar una combinación de técnicas para predecir la expansión de invernaderos en los próximos años. En cuanto al efecto potencial del Cambio del Clima sobre la flora, tratado en la Parte III, presento los resultados de cuatro trabajos: a) la primera simulación de alta resolución del desplazamiento potencial del hábitat idóneo de formaciones vegetales en el Parque Nacional de Sierra Nevada, desarrollando una técnica para la detección temprana de frentes de avance y retroceso de las poblaciones, y un método para pronosticar las dinámicas potenciales de sucesión de las formaciones vegetales; b) desarrollo de una herramienta informática (un flujo de trabajo automatizado) para facilitar y mejorar las proyecciones de cambio potencial en la distribución de la flora ante distintos escenarios de cambio climático; c) aplicación del flujo de trabajo para simular cambios en la idoneidad del hábitat en poblaciones de flora amenazada de zonas áridas (Hoyas de Guadix y Baza) y alta montaña (Sierra Nevada), para comparar el efecto potencial del cambio del clima en la flora rara y amenazada de ambos hábitats; d) simulación de cambios en la distribución de 198 especies de la flora andaluza, teniendo en cuenta factores como la migración o la tolerancia a nuevas condiciones, para estudiar el comportamiento potencial de la diversidad vegetal de Andalucía lo largo del siglo XXI.En los distintos trabajos trato de abordar dos perspectivas: una enfocada en el proceso de modelado, sus limitaciones y sus posibilidades de mejora, y otra dedicada a la interpretación biológica de los resultados.Esta no es una tesis experimental, sino una tesis de modelado y simulación, basada en los fundamentos biológicos de la ecología de plantas y en los métodos propios de la Ecoinformática. A consecuencia de los métodos utilizados, los resultados de los trabajos presentados están sujetos a la indeterminación inherente a eventos que aún no han tenido lugar.